Los trabajos desempeñados por los técnicos del IPCE en materia de arqueología consisten básicamente en:
- Planificación y gestión de las intervenciones arqueológicas, tanto terrestres como subacuáticas, vinculadas a las actuaciones de conservación y restauración de bienes culturales de propiedad y/o gestión de la Administración General del Estado.
- Estudio e investigación de carácter histórico-arqueológico de los bienes culturales en los que interviene el IPCE.
- Supervisión y seguimiento de las actuaciones arqueológicas que se llevan a cabo en las intervenciones realizadas por otros organismos dependientes del Ministerio de Cultura en yacimientos y monumentos propiedad del Estado.
- Planificación y seguimiento de las actuaciones arqueológicas que el IPCE realiza en colaboración con las Comunidades Autónomas, en bienes culturales, en el marco de los Planes Nacionales.